组织编制阿图什市重大水资源发展规划，重要河流湖泊流域综合规划、防洪规划等重大水利规划；编制水资源保护规划；组织开展大中型灌排工程建设与改造；指导农村饮水安全工程建设管理工作，指导节水灌溉有关工作；指导农村水利改革创新和社会化服务体系建设；指导农村水能资源开发与小水电改造；负责水土保持工作；负责建设项目水土保持监督管理工作，指导重点水土保持建设项目的实施；指导水利建设市场的监督管理，组织实施水利工程建设的监督；指导水利工程建设管理，制定有关制度并组织实施；组织重要河流干堤、重要病险水库、重要水闸的除险加固；负责水利行业工程质量、造价、监理的管理工作；指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设。