阿图什市位于天山北麓，塔里木盆地西缘，东邻阿克苏地区柯坪县，东北与克州阿合奇县相邻东南接喀什地区巴楚县，南与喀什地区伽师县和疏附县相连，西邻克州乌恰县，西北与吉尔吉斯斯坦共和国接壤。全市辖区总面积1.55万平方公里,建成区面积14.7平方公里边境线长88.3公里，通外山口15个。阿图什市下辖4乡3镇3街道共有87个村、30个社区。